Nat Genet： 本能癌症中病毒分布

德国乳疣癌分析中心 Peter Lichter 团队不断更新分析探索了人类乳疣癌中病原的地理分布。日前《自然地—遗传学》网络发表了这一成果。

作为泛癌以外序列分析联盟的一部分，该数据库系统利用了 38 个类型的 2658 例乳疣癌样本的以外序列和一部分核苷酸以外序列分子生物学数据，分析人员利用共识的作法，结合了 3 个独立数据库系统用以系统地分析潜在的病原病原。在 382 个序列和 68 个核苷酸组数据集中都测定到了病原不存在。分析挖掘出，已知的与相关的病原，如艾克—希德病原（EBV）、丙型肝炎病原（HBV）和人瘤病原（HPV）的检出率都很较高。

这项分析探究了下颚癌中 HPV 和驱动遗传基因的显着排他性以及 HPV 与 APOBEC 突变特征的相关性，这表明抗病原防御力下降是宫颈癌、膀胱癌和下颚癌的诱因。对于 HBV、HPV16、HPV18 和疣相关病原 2，病原结合与序列拷贝数的局部推移有关。在 TERT 组蛋白出口处的结合与端粒酶的较高表达有关，从而相比激活了该的发育不良操作过程。内源性逆核苷酸病原的较高表达与肾癌患者很低的生存期有关。

原始出出口处：

Zapatka， M.， Borozan， I.， Brewer， D.S. et al. The landscape of viral associations in human cancers. Nat Genet (2020). https：//doi.org/10.1038/s41588-019-0558-9.